| Funkce | Jméno | |
| rektor | Prof. RNDr. Václav Hampl, DrSc. | |
| prorektoři | pro studijní záležitosti | Prof. RNDr. Jan Bednář, CSc. (do 31. 1. 2010) |
| Doc. ThDr. Martin Prudký (od 22. 2. 2010) | ||
| pro akademické kvalifikace | Prof. PhDr. Mojmír Horyna (do 31. 1. 2010) | |
| Prof. PhDr. Ivan Jakubec, CSc. (od 22. 2. 2010) | ||
| pro celoživotní vzdělávání a rovné příležitosti | Prof. MUDr. Sylvie Opatrná, Ph.D. (od 1. 4. 2010) | |
| pro vědeckou a tvůrčí činnost | Prof. RNDr. Petr Volf, CSc. | |
| pro vnější vztahy | Doc. PhDr. Michal Šobr, CSc. | |
| pro zahraniční styky a mobilitu | Prof. MUDr. Jan Škrha, DrSc., MBA | |
| pro rozvoj | Prof. PhDr. Stanislav Štech, CSc. | |
| pro investiční výstavbu | Prof. RNDr. Milan Tichý, DrSc. (od 22. 2. 2010) | |
| kvestor | Ing. Josef Kubíček | |
| kancléř | RNDr. Tomáš Jelínek | |