| Fakulta/Součást | Jméno |
| KTF | Prof. PhDr. Ludvík Armbruster (do 16. 2. 2010) |
| ThLic. Prokop Brož, Th.D. (od 17. 2. 2010) | |
| ETF | Doc. ThDr. Martin Prudký (do 21. 2. 2010 |
| Doc. Jindřich Halama, Dr. (od 1. 6. 2010) | |
| HTF | Prof. ThDr. Jan B. Lášek |
| PF | Prof. JUDr. Aleš Gerloch, CSc. |
| 1.LF | Prof. MUDr. Tomáš Zima, DrSc., MBA |
| 2.LF | Doc. MUDr. Ondřej Hrušák, Ph.D. |
| 3.LF | Doc. MUDr. Bohuslav Svoboda, CSc. (do 31. 1. 2010) |
| Prof. MUDr. Michal Anděl, CSc. (od 1. 2. 2010) | |
| LFP | Doc. MUDr. Jaroslav Koutenský, CSc. (do 31. 1. 2010) |
| Doc. MUDr. Boris Kreuzberg, CSc. (od 1. 2. 2010) | |
| LFHK | Prof. MUDr. Vladimír Palička, CSc., Dr.h.c. (do 31. 8. 2010) |
| Prof. MUDr. RNDr. Miroslav Červinka, CSc. (od 1. 9. 2010) | |
| FaF | Doc. PharmDr. Alexandr Hrabálek, CSc. |
| FF | PhDr. Michal Stehlík, Ph.D. |
| PřF | Prof. RNDr. Bohuslav Gaš, CSc. |
| MFF | Prof. RNDr. Zdeněk Němeček, DrSc. |
| PedF | Doc. PaedDr. Radka Wildová, CSc. |
| FSV | Prof. RNDr. Jan Ámos Víšek, CSc. (do 31. 1. 2010) |
| PhDr. Jakub Končelík, Ph.D. (od 1. 2. 2010) | |
| FTVS | Prof. Ing. Václav Bunc, CSc. (do 31. 1. 2010) |
| Doc. PhDr. Vladimír Süss, Ph.D. (od 1. 2. 2010) | |
| FHS | Doc. PhDr. Ladislav Benyovszky, CSc. |
| ÚDAUK | Doc. PhDr. Petr Svobodný |
| CTS | Doc. David Storch, Ph.D. |
| CERGE | Doc. Ing. Štěpán Jurajda, Ph.D. |
| ÚVT | RNDr. Pavel Krbec, CSc. (do 28. 2. 2010) |
| RNDr. Štěpán Bojar (od 1. 4. 2010) | |
| CPPT | Ing. Jiří Linhart |
| ÚJOP | Mgr. Jan Podroužek |
| ÚK | Mgr. Marie Paráková |
| COŽP | Prof. RNDr. Bedřich Moldan, CSc. |
| ARVŠ | Ing. Václav Kuchař |
| KaM | Ing. Mojmír Bém |
| ArcS | ThLic. Artur Matuszek |
| Nakl | Mgr. Petr Valo (od 1. 1. 2010) |
| SBZ | Ing. Karel Höfer (do 31. 8. 2010) |
| Ing. Martin Marcoň (od 1. 9. 2010) | |
| SC | Karel Kozel |